Comunicazioni ISME
(2024). doi: 10.1093/ismico/ycae067
Un modo unico per monitorare la salute dei fiumi ha rivelato un esercito di minuscoli organismi che combattono per proteggere il fiume Brisbane. Dottorato di ricerca presso l’Università del Queensland. La candidata Apoorva Prabhu e il professore associato onorario Chris Reinke hanno guidato un team che ha campionato, sequenziato e valutato il DNA di migliaia di microrganismi in 3 sezioni del fiume Brisbane per un periodo di 12 mesi. La ricerca del team è pubblicatoNella rivista
Comunicazioni ISME
.
Sono stati campionati e identificati quasi 2.500 diversi genomi microbici, molti dei quali appartenenti a specie precedentemente inesplorate, formando il più grande database di genomi microbici mai realizzato per un estuario subtropicale.
“L’intera portata della diversità microbica nel fiume Brisbane non era ancora nota”, ha detto Prabhu. “I microbi sono un utile indicatore della salute dei nostri corsi d’acqua. Riciclano attivamente i nutrienti, trasformando carbonio, azoto, fosforo e zolfo.
“Sfortunatamente, nei siti di raccolta degli sterili del fiume Brisbane a Indooroopilly, Eagle Farm e Shorncliffe a Moreton Bay, abbiamo trovato un gran numero di microbi che si nutrono di sostanze nutritive come nitrato o fosforo, indicando una significativa contaminazione da attività umane come il deflusso agricolo.
“In particolare, un nuovo batterio che abbiamo chiamato Hypereutropica brisbanensis ha dimostrato di essere un importante indicatore di livelli elevati di nitrati e fosforo. Ogni volta che incontriamo questi batteri, i livelli di nutrienti nel fiume sono estremamente alti, e sfortunatamente la realtà è proprio così questi microbi restano ben nutriti, il fiume soffre.”
Il team ha utilizzato la metagenomica avanzata – un metodo progettato per studiare intere comunità di microrganismi – combinata con tecniche di apprendimento automatico per identificare un gran numero di nuovi microbi.
“Sorprendentemente, più dell’80% dei microrganismi che abbiamo trovato erano completamente nuovi per la scienza, evidenziando l’enorme diversità mai esplorata prima del fiume Brisbane inferiore”, ha affermato Prabhu. “Questa conoscenza è vitale per lo sviluppo di strategie efficaci”. “Per il monitoraggio e la gestione ambientale, perché ci racconta in modo concreto le problematiche più urgenti, in termini di inquinamento, che affliggono i nostri corsi d’acqua”.
Il dottor Reinke ha affermato che lo studio costituisce un punto di riferimento per la ricerca sull’ecologia microbica negli ambienti fluviali, in particolare nelle regioni subtropicali e tropicali come Brisbane.
“L’integrazione della genomica microbica e dell’apprendimento automatico fornisce un potente quadro per esplorare le comunità microbiche e le loro funzioni ecologiche”, ha affermato il dott. Rink.
“La ricerca futura può basarsi su questi risultati per spiegare le complesse interazioni all’interno degli ecosistemi microbici e le loro risposte ai cambiamenti ambientali. Il nostro prossimo obiettivo è concentrarsi sull’impatto delle inondazioni sulle comunità microbiche. Sono certo che il fiume Brisbane nasconde molti segreti in agguato le sue acque fangose.
Il team desidera riconoscere il contributo dei ricercatori della Scuola di Chimica e Bioscienza Molecolare dell’Università del Queensland e del Centro di ricerca sul microbioma dell’Università di Tecnologia del Queensland. maggiori informazioni: Apoorva Prabhu et al., L’apprendimento automatico e la metagenomica identificano taxa non caratterizzati che si ritiene guidino cicli biogeochimici in un estuario subtropicale ipertrofico, Comunicazioni ISME
doi: 10.1093/ismico/ycae067Fornito dall’Università del Queensland
la citazione
:Study Reveals Vital Microbes for Healthy Brisbane River (27 giugno 2024) Estratto il 27 giugno 2024 da https://phys.org/news/2024-06-reveals-microbes-vital-healthy-brisbane.html Questo documento è vulnerabile diritto d’autore. Nonostante qualsiasi comportamento corretto a scopo di studio o ricerca privata, nessuna parte può essere riprodotta senza autorizzazione scritta. Il contenuto è fornito solo a scopo informativo.
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